1. 应仁之乱：两军占据京都

畠山、斯波家继承争端，将相争的守护带到京都。将军足利义政先指定弟弟义视继任，后来儿子义尚出生，又增添不确定。细川胜元、山名宗全支持不同人选，不过1466年，两人曾合作反对义政宠信的顾问。

1467年日本旧历正月，畠山政长失去将军支持，退往上御灵神社。堂表兄弟义就获盟友帮助，进攻政长；胜元未提供所需援军，政长战败。至五月，规模更大的东西两方在城内交战。胜元控制将军居所，在位天皇、上皇也迁入。同年稍后大内政弘抵达，增强西军；相国寺周围战斗烧毁寺院、邻近街区。

设防住宅、战壕、连续战役，分割城市空间。大内书信认可具体武士军功，也讨论招募步卒。义视1468年加入西军，使将军继承主张成为西军一项诉求。双方都未迅速摧毁对方，地方冲突既向京都战争提供人手、资源，也把力量从京都调走。

宗全、胜元1473年去世，其继承人1474年议和，其他领袖仍继续作战。义就、政弘1477年撤出京都，主要城市战事结束，河内、邻区仍在战争中。山城地方领袖最终于1485年要求畠山两军都撤离。政府约束守护的能力削弱，城民、机构则承受长期占领、毁坏。

1. 继承争端把武士联盟带到京都

畠山家的继承争端，使堂表兄弟义就、政长相争。斯波家也有对立继承者，各获不同家臣、地方权益支持。将军认可影响官职、收入取得，家内争执因而可把其他守护卷入。

义政1464年指定弟弟义视为继承人，1465年义尚出生，使安排复杂。这项不确定与既有竞争交织，并未一夜形成两个固定派别。

细川胜元、山名宗全各有广泛的地方网络，1466年仍合作反对义政宠信的伊势贞亲、季琼真蕊，两名顾问逃出京都。两人先合作，后来各自联盟才交战。

义政随后重新支持义就，使政长失势。将军虽有直属家臣、官员，却无法强迫集聚的各武士家族接受安排；城中的武装人员即将检验这项决定。

畠山争端早已跨越多次裁决。义就1460年失去将军认可，以大和根据地抵抗讨伐军，1466年末返回京都，再次挑战政长已有地位。斯波家的义敏、义廉相争，也影响越前、尾张、远江守护职位。一人获认可，另一方支持者的官职、期待便随之改变。

裁决后果因而超出将军家。胜元、宗全可把对立人选同各自地方军队联系起来，早先反对贞亲、真蕊的合作，显示东西联盟随争端变化而形成。富子关心义尚地位，也是继承问题的一部分，却不足以单独解释畠山两方此前已发生的官职、地方控制之争。

宫廷也面对危险。在位天皇、上皇即将迁入将军居所求保护，这处政治中心既提供正式认可，也有防御。义政的官员、直属家臣仍是政府资源，却不足以让他解除所有带兵入京守护的武装。

2. 神社交战，市区设防，地方增援

1467年日本旧历正月，政长烧毁住宅，移往上御灵神社。翌日，义就获朝仓孝景、宗全一方帮助，进攻政长。胜元未派军事援助，政长失败，在全面城市战争前便改变畠山争端的力量对比。

随后数月，大军集聚。五月，一条、大宫附近遭到攻击，东西联盟的持续战斗展开。胜元控制义政居所花之御所，后土御门天皇、后花园上皇迁入，宫廷、将军同处东军防御之内。

八月，大内政弘带西军增援进入京都。攻击推进至相国寺周围，十月大战、火灾毁坏寺院建筑群。住宅、宗教场所成为阵地，战壕、设防院落阻碍街区间通行。

次年西军在船冈山附近作战。义视此前曾离京，1468年加入西军，西军领袖在各自家族诉求之外，也有了一位将军人选。

大内通信留下战役背后的部分运作。1467年书信赞扬Niho Hiroari在京都具体阵地的军功，相关书信讨论在摄津雇用大和步卒。招募、奖赏、调动追随者，使城市战斗同地方网络相连。

战线、联盟继续变化。朝仓孝景随着地方地位变化，1471年转入东军。战争扩至城外，需要给养，也须持续取得追随者合作；这些人的领地、对手都在别处。

东西之名描述联盟在京都的位置，各家并无共同统一的政治纲领。胜元也从地方攻击西军联盟：赤松政则袭击山名在播磨、备前、美作的领地，其他东军盟友则在别处挑战西军守护。地方资源受压，首都力量对比也可能改变。京都是指挥、权利认可中心，募兵、领土争端却超出城界。

控制将军所在中心仍有机构优势。西军领袖可能被撤去守护职，由东军人员替代，被撤职者却率军抵抗，新任命未必能让获任者进入相应地方。命令仍对权利主张者有用，持有头衔与实际行使权力，却并不相同。掌握将军因此重要，又不足以迅速达成和解。

防御工程也改变日常通行。考古讲座的复原描述住宅周围约三米宽的壕沟，将军院落也设防。挖掘、维护需要劳力。大内书信又记雇用步卒、确认具体阵地军功，显示招募、付酬劳动、军事认可如何维持行动，但未提供搬运、筑防、作战人员的完整名册。

讲座将不同时期挖出的战壕、烧毁堆积，同地图、文献年代比较。防御遗迹可说明城市变化，具体哪支部队挖壕、谁造成火灾，却未确定。1467年激战、后来的地方战役、占领区域接连变化，各有过程，未构成一场始终不停的战斗，也无法归为一幅确定的毁坏地图。

3. 西军撤出，京都主要战事结束

宗全、胜元1473年去世，两位主要联盟组织者消失，畠山、大内的诉求仍未解决。山名政丰、细川政元1474年议和，同年稍后再战，显示协议影响有限。

1477年，义就赴河内，政弘返回西部各国。主要西军在京都的阵地随撤离拆除，延续约十年的主要城市战事结束。

将军政府仍在。义尚已于战争中受任将军，宫廷继续任命统治者、官员，义政约束守护的早先能力却未随机构存续恢复。

京都留下毁坏建筑、被迫迁移的机构、围绕防御阵地重组的区域。地图、记录、考古材料分别说明不同占领阶段，年代各异，后来的烧毁遗迹未必属于开战时的战斗。

西军领袖撤离后的处境也不同。政弘恢复地方官职，义就未获赦免，仍在河内以武力建立地位。畠山争夺又将部队带入大和、南山城。京都主要阵地可经交涉撤去，一位身份未解决的人选，却仍在继续作战。

城内迁离既打断居住，也打断生产。京都织业史记述大舍人町工匠在战争期间逃往堺等地，后来返回、恢复生产、重新聚集。这段过程未说明每个街区在十年间始终尽毁；一户人家可以恢复手艺，同时别处仍有政治、军事争端。

义政后来的东山居所，又是另一阶段。1482年，他在战争中烧毁、此前弟弟义视曾住的净土寺原址营建住宅。建造住所及后来称银阁的楼阁，仍依靠禅僧、艺术工作的联系。这是主要城市战事结束后，对受损宗教场所的具体再利用，工程始于1482年，艺术资助并非开战时便突然取代政府事务。

4. 地方战争、居民抵抗与重建

两军离开京都后，河内、南山城仍在战争中。畠山两方取得地方支持，也提出相互竞争的军事要求。1485年山城国一揆要求双方军队离开，应对京都战事结束后未解决的冲突。

地方家臣得到议价、改变效忠、巩固地位的机会。朝仓孝景在越前的经历，显示广泛战争中的效力同较强地方根据地之间的联系。这类变化在各地进展速度不同。

军队占据有人生活的城市，京都居民、宗教机构承受代价。寺院可庇护迁离者，也可成为攻击目标。存世证据涉及具体位置、机构，各街区经历并不完全相同。

应仁之乱常被用作战国时代的开始。其具体作用在于，将军决定长期未能解决强大家族的争端，随后地方战争继续。此前冲突已削弱中央协调，后来的守护仍向京都寻求任命、认可。

织业区有具体的重建过程。返回工匠在旧东军总部附近白云村组成练贯座，又在旧西军总部附近大宫一带组成大舍人座；两个行会竞争，生产同时恢复。意为西军营地的“西阵”，在1487年日记中已作为地名出现。今天织业范围比十五世纪军事阵地更广，地名保存战争联系，却未保留一条现今仍有效的营地边界。

文化联系也随迁移、资助变化。公卿、僧人离京赴地方根据地，综合历史记述举出一条教房迁至土佐中村、京都禅僧在山口活动。地方资助者因而接触离京的人才、学问；义政东山营建则仍有禅宗顾问、艺术专门人员参与。文化由此延续、重新分布，其他居民损失的住所、收入却未因此恢复。

政治分裂还涉及谁能执行决定。朝仓加强地方地位，山城联盟要求对立军队撤走，这是两种不同回应，未在1467年自动发生于每国。守护、代理人、地方武士仍用京都头衔、关系争取实际控制。战争改变了追求这些诉求的条件，首都机构仍在，却越来越难平息周围武装争端。